Januzaj bắt đầu sự nghiệp cầu thủ ở câu lạc bộ FC Brussels nhưng sau đó đã gia nhập câu lạc bộ Anderlecht khi mới 10 tuổi vào năm 2005.[4] Anh rời Anderlecht để chuyển đến Manchester United vào tháng 3 năm 2011 khi mới 16 tuổi sau khi gây ấn tượng trong một buổi tập tại Brussels.[5]

Cuối mùa giải 2012-2013, Sir Alex Ferguson đã chính thức đôn Januzaj lên đội một và trao cho cầu thủ này số áo 44. Sir Alex Ferguson đã điền tên anh vào trận đấu cuối cùng của mùa giải gặp West Bromwich Albion, nhưng anh không được sử dụng trong trận đấu.[6] Với màn trình diễn ấn tượng, Januzaj đã giành được giải thưởng Denzil Haroun, cầu thủ đội dự bị xuất sắc nhất năm.[7] Trong chuyến du đấu hè 2013, anh đã được đưa vào đội hình chính trong 2 trận gặp Clb Kitchee và Sevilla. Anh góp mặt trong đội hình chính cho chuyến du đấu châu Á hè 2013 và ghi bàn trong trận đấu cuối cùng gặp Kitchee của Hồng Kông. Trong trận đấu tôn vinh Rio Ferdinand trên sân Old Trafford; Januzaj được ra sân trong đội hình xuất phát và đóng góp được một đường kiến tạo cho bàn thắng duy nhất của đội bóng, tuy vậy Man United vẫn phải nhận trận thua 3–1 trước Sevilla.[8]

11 tháng 8 năm 2013, Januzaj có trận đấu ra mắt đầu tiên cho Manchester United trước Wigan Athletic ở trận tranh Community Shield cup, khi anh vào sân thay thế Robin van Persie trong 6 phút cuối trận.[9]

Một tháng sau đó, anh lần đầu tiên được thi đấu tại giải ngoại hạng khi vào sân thay Ashley Young ở phút 68 trong trận thắng 2–0 trên sân nhà trước Crystal Palace ngày 14 tháng 9.[10]

Ngày 5 tháng 10 năm 2013, Januzaj được điền tên vào đội hình xuất phát gặp Sunderland, anh đã ghi 2 bàn thắng để đem về chiến thắng cho Manchester United.[11]

Tháng 12 năm 2014, Januzaj đã ký vào bản hợp đồng mới với thời hạn 5 năm với mức lương 30.000 Bảng Anh.[12]

Tháng 12 năm 2013, Januzaj được đề cử cho giải thưởng BBC Young Sports Personality of the Year sau 10 trận đã đá cho Manchester United [13].

Ngày 10 tháng 12 năm 2013, Januzaj có trận đấu đầu tiên tại UEFA Champions League gặp Shakhtar Donetsk.[14]